Зертхана ғылыми-зерттеу жұмыстарының тиімділігін арттыру мақсатында жоғары және жоғарыдан кейінгі білім беру ұйымдары, ғылыми-зерттеу мекемелері мен өндірістік кәсіпорындармен ынтымақтастық орнатқан. Олардың қатарында:
– «ITMO Ұлттық зерттеу университеті» (Санкт-Петербург, РФ);
– Астрахань мемлекеттік сәулет-құрылыс университеті (Астрахань, РФ);
– Мари мемлекеттік университеті (Йошкар ола, РФ);
– Беларусь ұлттық техникалық университеті (Минск, БР);
– Брест мемлекеттік техникалық университеті (Брест, БР);
– Беларусь мемлекеттік технологиялық университеті (Минск қ., РБ);
– Ю. Кондратюк атындағы Полтава ұлттық техникалық университеті (Полтава, Украина);
– Қырғыз Ғылым академиясының Математика институты (Бішкек, Қырғызстан);
– Л.Н. Гумилев атындағы Еуразия ұлттық университеті (Астана, ҚР);
– А. Бектұров атындағы Химия ғылымдары институты АҚ (Алматы, ҚР);
– С. Сейфуллин атындағы Қазақ агротехникалық университеті АҚ (Астана, ҚР);
– Ә. Сағынов атындағы Қарағанды техникалық университеті (Қарағанды, ҚР);
– М. Әуезов атындағы Оңтүстік Қазақстан университеті. (Шымкент, ҚР);
– Академик К. Сәтбаев атындағы Екібастұз инженерлік-техникалық институты (Екібастұз, ҚР);
– «ҚазАгрЭкс» Жамбыл облыстық сынақ зертханасы (Тараз, ҚР);
– «ҚазСҚҒЗИ» АҚ ЖОФ;
– «Қазфосфат» ЖШС (Тараз, ҚР);
– «Қазақ ауыл шаруашылығы өнімдерін қайта өңдеу ғылыми-зерттеу институты» ЖШС (Астана, ҚР);
– «Заң» ЖШС;
– «Абсент» ШҚ;
– «Өркен» ЖК және т.б. бар. Зертхана ғылыми-техникалық жұмыстар аясында басқа да ұйымдар тарапынан кәсіби серіктестік пен ынтымақтастық бойынша ұсыныстар қабылдауға дайын.